Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nedd4P46935 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms