Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sept1P42209 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms