Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgclP38060 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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