Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms