Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rab5cP35278 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rab5cP35278 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rab5cP35278 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rab5cP35278 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rab5cP35278 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rab5cP35278 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rab5cP35278 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rab5cP35278 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rab5cP35278 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rab5cP35278 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rab5cP35278 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rab5cP35278 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5cP35278 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Rab5cP35278 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms