Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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Saa4P31532 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Saa4P31532 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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