Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms