Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Celf1P28659 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Celf1P28659 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms