Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pde6aP27664 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pde6aP27664 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pde6aP27664 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pde6aP27664 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pde6aP27664 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pde6aP27664 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms