Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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