Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CftrP26361 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CftrP26361 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CftrP26361 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CftrP26361 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CftrP26361 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CftrP26361 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CftrP26361 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CftrP26361 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CftrP26361 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CftrP26361 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CftrP26361 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CftrP26361 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CftrP26361 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CftrP26361 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CftrP26361 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CftrP26361 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CftrP26361 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CftrP26361 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CftrP26361 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CftrP26361 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CftrP26361 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CftrP26361 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CftrP26361 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CftrP26361 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CftrP26361 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CftrP26361 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CftrP26361 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CftrP26361 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CftrP26361 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CftrP26361 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CftrP26361 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CftrP26361 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CftrP26361 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CftrP26361 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CftrP26361 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CftrP26361 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CftrP26361 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CftrP26361 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms