Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd12P23812 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms