Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gja1P23242 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gja1P23242 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gja1P23242 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms