Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PparaP23204 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PparaP23204 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PparaP23204 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PparaP23204 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PparaP23204 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PparaP23204 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PparaP23204 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PparaP23204 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PparaP23204 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PparaP23204 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms