Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmnb2P21619 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmnb2P21619 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms