Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
P20040 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
P20040 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
P20040 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P20040 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P20040 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P20040 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P20040 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P20040 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P20040 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P20040 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P20040 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P20040 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P20040 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
P20040 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P20040 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
P20040 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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