Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a1P19437 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a1P19437 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms