Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NelfeP19426 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NelfeP19426 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms