Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnnc1P19123 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnnc1P19123 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnnc1P19123 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms