Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsdP18242 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsdP18242 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsdP18242 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsdP18242 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtsdP18242 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtsdP18242 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtsdP18242 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtsdP18242 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtsdP18242 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsdP18242 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtsdP18242 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms