Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou4f1P17208 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou4f1P17208 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms