Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcna1P16388 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms