Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp53P15975 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms