Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FosbP13346 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosbP13346 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosbP13346 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosbP13346 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosbP13346 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms