Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nr4a1P12813 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nr4a1P12813 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms