Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms