Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp1P11438 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms