Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ly6c1P0CW02 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms