Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Me1P06801 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Me1P06801 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Me1P06801 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Me1P06801 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Me1P06801 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Me1P06801 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Me1P06801 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Me1P06801 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Me1P06801 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Me1P06801 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Me1P06801 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Me1P06801 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Me1P06801 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Me1P06801 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Me1P06801 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Me1P06801 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Me1P06801 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Me1P06801 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Me1P06801 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Me1P06801 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Me1P06801 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms