Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms