Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgfb1P04202 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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