Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GzmbP04187 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GzmbP04187 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms