Protein–RNA interactions for Protein: P03980

Ig heavy chain V region TEPC 1017, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03980 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P03980 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P03980 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P03980 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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