Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
H2-Ab1P01921 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms