Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sap30O88574 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sap30O88574 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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