Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp4O70480 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms