Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkbO70126 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkbO70126 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.05■□□□□ 0
AurkbO70126 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AurkbO70126 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AurkbO70126 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AurkbO70126 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AurkbO70126 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
AurkbO70126 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AurkbO70126 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AurkbO70126 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkbO70126 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkbO70126 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkbO70126 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkbO70126 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AurkbO70126 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AurkbO70126 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AurkbO70126 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AurkbO70126 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AurkbO70126 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AurkbO70126 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkbO70126 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkbO70126 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkbO70126 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkbO70126 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkbO70126 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkbO70126 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkbO70126 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkbO70126 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms