Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ptpn20O55082 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms