Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarce1O54941 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms