Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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FxnO35943 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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FxnO35943 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FxnO35943 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FxnO35943 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FxnO35943 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FxnO35943 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FxnO35943 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FxnO35943 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FxnO35943 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FxnO35943 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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FxnO35943 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FxnO35943 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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