Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

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Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm44O35857 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Timm44O35857 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Timm44O35857 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms