Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag2O35638 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms