Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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