Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms