Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
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Ptpn9O35239 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
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Ptpn9O35239 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Ptpn9O35239 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Ptpn9O35239 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Ptpn9O35239 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn9O35239 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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Ptpn9O35239 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Ptpn9O35239 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Ptpn9O35239 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptpn9O35239 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms