Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20878L7N244 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms