Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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