Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930544D05RikJ3QK56 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
4930544D05RikJ3QK56 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms