Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cldn34c3J3QJW5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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