Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20828J3KMI7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms